Główny Księgowy w szczególności realizuje zadania wynikające z ustawy o finansach publicznych, prowadzi rachunkowość Uniwersytetu Opolskiego, dokonuje dyspozycji środków pieniężnych w zakresie wynikającym z przepisów i upoważnień, oraz sprawuje wstępną kontrolę zgodności operacji gospodarczych i finansowych z planem finansowym. Nadzoruje pracę Kwestury, w skład której wchodzą Biuro Rachunkowości oraz Biuro Rachuby Wynagrodzeń.
W ramach powierzonych obowiązków Główny Księgowy sprawuje nadzór nad prawidłowym obiegiem dokumentów finansowo–księgowych w Uczelni, w tym nad ich weryfikacją formalno–rachunkową oraz zgodnością z obowiązującymi procedurami wewnętrznymi, przepisami prawa rachunkowego, podatkowego oraz przepisami dotyczącymi finansów publicznych.
Główny Księgowy dokonuje również kontrasygnaty finansowej dokumentów skutkujących powstaniem zobowiązań finansowych oraz innych dokumentów wywołujących skutki finansowe dla Uczelni, w tym umów, aneksów, zamówień oraz dyspozycji finansowych, zgodnie z udzielonymi upoważnieniami i obowiązującymi procedurami wewnętrznymi.
Ponadto Główny Księgowy odpowiada za zapewnienie prawidłowego funkcjonowania systemu kontroli wewnętrznej w obszarze finansowo–księgowym, w szczególności w zakresie zapewnienia rzetelności, kompletności i terminowości zapisów księgowych oraz zgodności realizowanych operacji z planem rzeczowo–finansowym Uczelni.